Клиника специализируется на лечении детей со следующими заболеваниями:
доброкачественные опухоли и опухолеподобные заболевания костей (аневризмальная костная киста, солитарная костная киста, неостеогенная фиброма, фиброзно-кортикальный дефект, остеоид-остеома, остеома, хондрома, хондробластома, фиброма остеобластокластома);
ортопедические осложнения после перенесенного остеомиелита (различной этиологии при давности острого процесса не менее 1 года) (анкилозы, вывихи, контрактуры суставов, искривление и укорочение конечностей);
врожденные и приобретенные ложные суставы и дефекты костей (костей голени,бедренной кости, ключиц, плечевой кости, костей предплечья);
врожденное высокое стояние лопатки (болезнь Шпренгеля);
диспластические системные поражения (дисхондроплазия (болезнь Олье), ахондроплазия, гипохондроплазия, экзостозная хондродисплазия, дисхондроплазия, болезнь Блаунта, болезнь Маделунга, множественная деформирующая суставная хондродисплазия (болезнь Волкова), локальные формы фиброзной дисплазии, эозинофильная гранулема);

ортопедические осложнения после перенесенного рахита, рахитоподобных заболеваний;
врожденная мышечная кривошея;
врожденная варусная деформация шейки бедренной кости (coxa vara congenita).
В развитие лечения детей с костной патологией большой вклад внесли профессора Л.К.Закревский, П.Я.Фищенко, В.Л.Андрианов, С.В.Филатов. Сотрудниками клиники используются самые современные методы лечения пациентов с применением различных вариантов костной пластики и различных видов костнопластических материалов, методов дистракционного остеосинтеза.
Полученные в процессе исследований новые сведения об этиологии и особенностях течения заболеваний позволили усовершенствовать известные и разработать новые эффективные методы лечения костной патологии, значительно превосходящие мировые аналоги. Они защищены 32 патентами и авторскими свидетельствами. Специалисты отделения осуществляют консультативный прием в консультативно-диагностическом отделении института.