В период Первой мировой войны Генрих Иванович Турнер одним из первых в России широко пропагандировал идею создания специализированных учреждений для лиц, подвергшихся ампутации конечностей, где могли бы осуществляться квалифицированная хирургическая помощь и снабжение протезами увечных воинов с последующим их трудоустройством. В этой связи Г. И. Турнер подчёркивал необходимость создания особых учреждений, всеми средствами преследующих возможное сохранение трудоспособности увечного. Такими учреждениями он считал военно-ортопедические институты, которые должны были быть местом сосредоточения воинов, лишившихся конечностей и требующих протезов.
Кроме того, Генрих Иванович считал, что благотворная сторона снабжения протезами не должна заканчиваться с моментом выдачи протеза. Получивший искусственную ногу должен покинуть учреждение, освоившись вполне с новым приобретением и свободно им пользуясь, а не унося «ногу» подмышкой, опираясь на костыли.
Правильность высказанного Г. И. Турнером положения всецело подтвердилась в период Великой Отечественной войны, когда благодаря широко развёрнутой сети специализированных эвакогоспиталей для ампутированных была создана возможность в максимально короткие сроки возвратиться к трудовой деятельности.
Сотрудникам Института им. Г. И. Турнера, эвакуированным в 1942 году в Уфу, пришлось работать в нескольких госпиталях. Первый эвакогоспиталь, в который они приехали, был ЭГ № 2577 в посёлке Юматово. Госпиталь был развёрнут в двух корпусах, в 6 отделениях на 800 койко-мест. Уже 8 августа 1941 года госпиталь принял первый эшелон с ранеными.
В 1943 году Институт им. Г. И. Турнера базировался в Уфе в трёх эвакогоспиталях: ЭГ № 1742, ЭГ № 1320 и в больнице Восстановительной хирургии. Разрозненное нахождение в разных госпиталях создавало трудности в работе, поэтому к концу года все сотрудники были собраны в одно место и работали в больнице Восстановительной хирургии для инвалидов Отечественной войны. Несмотря на нехватку штатных единиц, сотрудники Института имени Г. И. Турнера работали в Уфе с полной отдачей, не жалея сил восстанавливали здоровье раненых, которые возвращались на фронт, помогали инвалидам учиться жить в новых условиях, давали им возможность освоить профессии для мирной жизни.
В 2022 году была написана книга «ГОДЫ ВЕЛИКОГО ТРУДА ВРАЧЕЙ ИНСТИТУТА ТУРНЕРА 1941-1945» (C. В. Виссарионов, С. В. Вилинская, А. В. Овечкина), посвящённая деятельности Института им. Г. И. Турнера в 1941-1945 годах и его вкладу в здравоохранение во время Великой Отечественной войны. Сведения о военном периоде жизни и деятельности Института имени Г. И. Турнера добывались по крупицам из самых разных источников, с использованием значительного объёма архивных документов, научных отчётов, автобиографий и других материалов, в том числе ранее неопубликованных. Авторы собрали для потомков свидетельства колоссального труда и не прекращавшейся научной деятельности сотрудников Института имени Г. И. Турнера; рассказали о каждом из отделений Института, действовавших все годы войны; отдали дань памяти и уважения людям, посвятившим жизнь служению детям и Отчизне. Мы помним и гордимся подвигом врачей, медицинских сестёр, педагогов, всего «военного» коллектива Института имени Г. И. Турнера!